盡管根據(jù)臨床癥狀和體征以及EB 病毒血清學(xué)、CT/MRI影像和間接鼻咽鏡或鼻咽光導(dǎo)（電子）纖維鏡檢查及病理活檢，一般不難對(duì)鼻咽癌作出正確診斷。然而，在臨床上仍需要根據(jù)鼻咽腫物及頸淋巴結(jié)的特點(diǎn)與鼻咽腺樣體增生、鼻咽結(jié)核、鼻咽壞死性肉芽腫、鼻咽血管纖維瘤、鼻咽脊索瘤、頸淋巴結(jié)結(jié)核、頸淋巴結(jié)炎、惡性淋巴瘤、以及顱內(nèi)鞍區(qū)腫瘤如垂體瘤、顱咽管瘤侵及鼻咽頂壁的良性和惡性病變等疾患鑒別。