發(fā)病機理較為復(fù)雜，致病菌借菌毛粘附于腸粘膜上皮細(xì)胞,使細(xì)菌能在腸壁生長繁殖,成為致病的先決條件。細(xì)菌性腸炎的病原菌可分產(chǎn)腸毒素性和侵襲性兩大類。不同病原菌引起的腸炎，有不同的發(fā)病機理和臨床表現(xiàn)。

　　腸毒素性細(xì)菌性腸炎。如霍亂，發(fā)病機理是致病菌粘附而不侵入腸粘膜，在細(xì)菌生長繁殖過程中分泌腸毒素，和小腸粘膜的上皮細(xì)胞膜受體結(jié)合，激活細(xì)胞膜上的腺苷酸環(huán)化酶，在該酶的催化下，使細(xì)胞內(nèi)的三磷酸腺苷 (ATP)轉(zhuǎn)化成環(huán)磷酸腺苷(cAMP)。當(dāng)細(xì)胞內(nèi)cAMP的水平升高時，通過一系列的酶反應(yīng)，使小腸粘膜大量分泌水和電解質(zhì),潴留在腸腔內(nèi)引起水瀉,稱為“分泌性腹瀉”。此類病人除小腸粘膜上皮細(xì)胞有分泌亢進(jìn)外，腸道的病理改變往往沒有或者很輕。病原體主要感染小腸，因此基本臨床表現(xiàn)是腹瀉次數(shù)較多，為大量水樣便，無膿血，一般無腹痛,無里急后重感,常伴有嘔吐，容易發(fā)生脫水、電解質(zhì)紊亂及酸中毒，全身中毒癥狀較輕。大便鏡檢常無紅、白細(xì)胞或少。

　　侵襲性細(xì)菌性腸炎。如細(xì)菌性痢疾，致病菌粘附并侵入腸粘膜和粘膜下層，引起明顯的炎癥。不同的病原菌侵犯腸的部位不同，有的侵犯小腸為主，有的侵犯結(jié)腸為主，有的引起小腸和結(jié)腸炎癥。此類腸炎的基本臨床表現(xiàn)是：全身毒血癥明顯,有高熱,重癥病人可發(fā)生感染性休克。大便可呈粘液膿血便，便量少，便次多。腹痛明顯，呈陣發(fā)性絞痛。若病變侵及下部結(jié)腸特別是直腸，可出現(xiàn)里急后重感。乙狀結(jié)腸鏡檢查，可見彌漫性炎癥及潰瘍。若僅侵襲小腸或上部結(jié)腸，則大便含水量較多，不伴里急后重。大便鏡檢有多數(shù)白細(xì)胞，尤其是下部結(jié)腸炎時更為明顯。